Hola, tengo el ubuntu 6.10 y me gustaría instalarlo en mi ordenador, tengo dos discos duros y en cada uno de ellos un Windows diferente, al meter el cd de ubuntu y darle a instalar me preguntara antes en que disco duro quiero ponerlo no? al elegir el que yo quiera, primero se formatea el disco y luego lo instala? gracias.

Mira, te aconsejo leer la siguiente referencia del tema:

Convivir WinXP y Kubuntu