Hay algún programa que repare un disco duro. Para seguirlo utilizando aunque quede con menos capacidad.

Que tal, en realidad existen diversos programas que hacen esa función, los mejores no son gratuitos lamentablemente.

En el siguiente enlace puedes descargar algunos que te ayudaran para tal fin.
http://www.softonic.com/index.phtml?modo=2&n_id_plat=1&n_id=183&serv=4

Saludos.

Si no son muy grandes los daños creo que haciendo un chkdsk (Scandisk del XP) se ocultan los sectores defectuosos.
Y si son grandes pero separados a una mala hacer particiones.

Suerte.

Mira no hay problemas en que lo hagas con un formato mas pequeño. Puedes poner en tu maquina en particiones, el disco se puede partir en varios sectores de aplicación puedes tener Windows 98 y Windows NT en el mismo disco. ok.